Muzeum znajduje się na terenie dawnego niemieckiego nazistowskiego więzienia na Radogoszczu. W okresie wojny pełniło funkcję aresztu przejściowego, z którego osadzeni wysyłani byli więzień i obozów koncentracyjnych. Więźniowie przebywali w ciężkich warunkach i zaostrzonym rygorze. Do największej tragedii doszło w nocy z 17 na 18 stycznia 1945 roku. Tuż przed wkroczeniem Armii Czerwonej Niemcy dokonali masakry więźniów podpalając główny budynek. Zginęło około 1500 osób. Życie uratowało zaledwie 30. Ekspozycję prezentującą historię miejsca otwarto w 1976 roku. W 2018 przeprowadzono prace modernizacyjne. Obecnie trwa budowa wystawy stałej prezentującej dzieje Kraju Warty i więzienia na Radogoszczu.
